MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 109476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_019965	CCG	2	6	248638	248643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640340
6003	NC_019965	GT	3	6	248685	248690	0 %	50 %	50 %	0 %	433640340
6004	NC_019965	GCAT	2	8	248717	248724	25 %	25 %	25 %	25 %	433640340
6005	NC_019965	TGG	2	6	248732	248737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640340
6006	NC_019965	GCC	2	6	248757	248762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_019965	CGG	2	6	248795	248800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_019965	CTG	2	6	248812	248817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_019965	CGG	2	6	248828	248833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_019965	CCA	2	6	248842	248847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_019965	GAAC	2	8	248852	248859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_019965	TCG	2	6	248899	248904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640341
6013	NC_019965	CCA	2	6	248923	248928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640341
6014	NC_019965	CCG	2	6	248932	248937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
6015	NC_019965	GCC	2	6	248967	248972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
6016	NC_019965	GGGT	2	8	249007	249014	0 %	25 %	75 %	0 %	433640341
6017	NC_019965	GC	4	8	249027	249034	0 %	0 %	50 %	50 %	433640341
6018	NC_019965	TCG	2	6	249054	249059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640341
6019	NC_019965	GTC	2	6	249111	249116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640341
6020	NC_019965	CGC	2	6	249161	249166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
6021	NC_019965	GGT	2	6	249179	249184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640341
6022	NC_019965	GGCC	2	8	249209	249216	0 %	0 %	50 %	50 %	433640341
6023	NC_019965	GC	3	6	249259	249264	0 %	0 %	50 %	50 %	433640341
6024	NC_019965	CGA	2	6	249329	249334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640341
6025	NC_019965	TGA	2	6	249338	249343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640341
6026	NC_019965	GCC	2	6	249372	249377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
6027	NC_019965	GGC	2	6	249425	249430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640341
6028	NC_019965	CGGTTG	2	12	249456	249467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433640341
6029	NC_019965	GGCCG	2	10	249517	249526	0 %	0 %	60 %	40 %	433640341
6030	NC_019965	CCG	3	9	249604	249612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
6031	NC_019965	CGG	2	6	249630	249635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640341
6032	NC_019965	CGG	2	6	249689	249694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640341
6033	NC_019965	CGA	3	9	249716	249724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640341
6034	NC_019965	GGC	2	6	249743	249748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640341
6035	NC_019965	GCC	2	6	249804	249809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640341
6036	NC_019965	GCGGT	2	10	249822	249831	0 %	20 %	60 %	20 %	433640341
6037	NC_019965	GCGGA	2	10	249874	249883	20 %	0 %	60 %	20 %	433640341
6038	NC_019965	CG	3	6	249962	249967	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6039	NC_019965	TGA	2	6	249973	249978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640342
6040	NC_019965	CCGG	2	8	249980	249987	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6041	NC_019965	TGG	2	6	249999	250004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
6042	NC_019965	TCA	2	6	250044	250049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640342
6043	NC_019965	CCG	2	6	250051	250056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640342
6044	NC_019965	GGT	2	6	250060	250065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
6045	NC_019965	TGGC	2	8	250082	250089	0 %	25 %	50 %	25 %	433640342
6046	NC_019965	GC	3	6	250105	250110	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6047	NC_019965	TCG	2	6	250143	250148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640342
6048	NC_019965	GTG	2	6	250187	250192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
6049	NC_019965	GTT	2	6	250196	250201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640342
6050	NC_019965	CCG	2	6	250248	250253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640342
6051	NC_019965	GGT	2	6	250270	250275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
6052	NC_019965	CG	5	10	250348	250357	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6053	NC_019965	GCC	2	6	250391	250396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640342
6054	NC_019965	GAC	2	6	250424	250429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640342
6055	NC_019965	CGC	2	6	250435	250440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640342
6056	NC_019965	CG	3	6	250471	250476	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6057	NC_019965	TGCG	2	8	250488	250495	0 %	25 %	50 %	25 %	433640342
6058	NC_019965	CG	3	6	250519	250524	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6059	NC_019965	CGG	2	6	250556	250561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640342
6060	NC_019965	AC	3	6	250630	250635	50 %	0 %	0 %	50 %	433640342
6061	NC_019965	GC	4	8	250645	250652	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6062	NC_019965	TGC	2	6	250707	250712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640342
6063	NC_019965	CG	3	6	250779	250784	0 %	0 %	50 %	50 %	433640342
6064	NC_019965	AGG	2	6	250794	250799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640342
6065	NC_019965	CGG	2	6	250896	250901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640342
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6071	NC_019965	CTG	2	6	251111	251116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640342
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6073	NC_019965	GGTGA	2	10	251147	251156	20 %	20 %	60 %	0 %	433640342
6074	NC_019965	GTG	2	6	251174	251179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640342
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6077	NC_019965	GCT	2	6	251218	251223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640342
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6081	NC_019965	CGG	2	6	251358	251363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640342
6082	NC_019965	GTGC	2	8	251384	251391	0 %	25 %	50 %	25 %	433640342
6083	NC_019965	GTT	2	6	251447	251452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_019965	CGC	2	6	251549	251554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_019965	CGA	2	6	251655	251660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640343
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6090	NC_019965	CG	3	6	251854	251859	0 %	0 %	50 %	50 %	433640343
6091	NC_019965	CAA	2	6	251914	251919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640343
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6093	NC_019965	CAT	2	6	251947	251952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640343
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6099	NC_019965	TGGCC	2	10	252198	252207	0 %	20 %	40 %	40 %	433640343
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6104	NC_019965	TAC	2	6	252404	252409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640343
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6115	NC_019965	GCA	2	6	252919	252924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640343
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6118	NC_019965	TGC	2	6	253014	253019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640343
6119	NC_019965	ACT	2	6	253044	253049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640343
6120	NC_019965	TTC	2	6	253106	253111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433640343
6121	NC_019965	GAC	2	6	253133	253138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640343
6122	NC_019965	TCG	2	6	253191	253196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640343
6123	NC_019965	CGG	2	6	253216	253221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640343
6124	NC_019965	ACC	2	6	253226	253231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433640343
6125	NC_019965	GGA	2	6	253255	253260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640343
6126	NC_019965	GGAC	2	8	253270	253277	25 %	0 %	50 %	25 %	433640343
6127	NC_019965	CGC	2	6	253288	253293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640343
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6129	NC_019965	TCG	2	6	253371	253376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640343
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6131	NC_019965	GCG	2	6	253508	253513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640344
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6135	NC_019965	CT	3	6	253557	253562	0 %	50 %	0 %	50 %	433640344
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6139	NC_019965	GTG	2	6	253692	253697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640344
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6157	NC_019965	GAAA	2	8	254531	254538	75 %	0 %	25 %	0 %	433640345
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6184	NC_019965	GGA	2	6	255881	255886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6185	NC_019965	AGA	2	6	255893	255898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6199	NC_019965	CTG	2	6	256359	256364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640346
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6231	NC_019965	GTAGCC	2	12	257678	257689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433640347
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6235	NC_019965	TCGG	2	8	257884	257891	0 %	25 %	50 %	25 %	433640347
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6237	NC_019965	CG	3	6	257961	257966	0 %	0 %	50 %	50 %	433640347
6238	NC_019965	TCA	2	6	257998	258003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640347
6239	NC_019965	CCCGG	2	10	258135	258144	0 %	0 %	40 %	60 %	433640347
6240	NC_019965	CGA	2	6	258148	258153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640347
6241	NC_019965	GGTC	2	8	258193	258200	0 %	25 %	50 %	25 %	433640347
6242	NC_019965	CGG	2	6	258228	258233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640347
6243	NC_019965	CAA	2	6	258266	258271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433640347
6244	NC_019965	CCG	2	6	258336	258341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640347
6245	NC_019965	TGG	2	6	258358	258363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640347
6246	NC_019965	CGA	2	6	258442	258447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640347
6247	NC_019965	GCCC	2	8	258454	258461	0 %	0 %	25 %	75 %	433640347
6248	NC_019965	CCG	2	6	258540	258545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640347
6249	NC_019965	TCG	2	6	258552	258557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640347
6250	NC_019965	ACGG	2	8	258635	258642	25 %	0 %	50 %	25 %	433640347
6251	NC_019965	TCG	3	9	258696	258704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640347
6252	NC_019965	CGG	2	6	258807	258812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640348
6253	NC_019965	GCC	2	6	258889	258894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640348
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6259	NC_019965	GAC	2	6	259285	259290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640348
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6261	NC_019965	CCG	2	6	259325	259330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640348
6262	NC_019965	CGGTG	2	10	259404	259413	0 %	20 %	60 %	20 %	433640348
6263	NC_019965	GGCTC	2	10	259455	259464	0 %	20 %	40 %	40 %	433640348
6264	NC_019965	GCT	2	6	259477	259482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640348
6265	NC_019965	GAC	2	6	259508	259513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640348
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6273	NC_019965	GTC	2	6	260151	260156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640349
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6279	NC_019965	CCG	2	6	260285	260290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640349
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6284	NC_019965	CAG	2	6	260472	260477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640349
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6286	NC_019965	TGC	2	6	260495	260500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640349
6287	NC_019965	CGG	2	6	260501	260506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640349
6288	NC_019965	G	6	6	260559	260564	0 %	0 %	100 %	0 %	433640349
6289	NC_019965	CGA	3	9	260588	260596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640349
6290	NC_019965	GACC	2	8	260627	260634	25 %	0 %	25 %	50 %	433640349
6291	NC_019965	GAC	2	6	260649	260654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640349
6292	NC_019965	TGG	2	6	260779	260784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6293	NC_019965	TGA	2	6	260787	260792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640350
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6296	NC_019965	CCG	2	6	260873	260878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640350
6297	NC_019965	TGG	2	6	260955	260960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640350
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6299	NC_019965	GGCCA	2	10	261020	261029	20 %	0 %	40 %	40 %	433640350
6300	NC_019965	GGCT	2	8	261044	261051	0 %	25 %	50 %	25 %	433640350
6301	NC_019965	CGTC	2	8	261080	261087	0 %	25 %	25 %	50 %	433640350
6302	NC_019965	TGGGGC	2	12	261120	261131	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433640350
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6307	NC_019965	CGAT	2	8	261413	261420	25 %	25 %	25 %	25 %	433640350
6308	NC_019965	TGC	2	6	261558	261563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640350
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6312	NC_019965	CCG	5	15	261675	261689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640350
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6315	NC_019965	AGT	2	6	261751	261756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640350
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6317	NC_019965	GGT	2	6	261825	261830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640350
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6319	NC_019965	GCT	2	6	261874	261879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640350
6320	NC_019965	GGCG	2	8	261880	261887	0 %	0 %	75 %	25 %	433640350
6321	NC_019965	CGG	2	6	261891	261896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640350
6322	NC_019965	GCG	2	6	261927	261932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640350
6323	NC_019965	GGCGA	2	10	261941	261950	20 %	0 %	60 %	20 %	433640350
6324	NC_019965	GGC	2	6	261955	261960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640350
6325	NC_019965	GCT	2	6	261985	261990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640350
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6328	NC_019965	CTG	2	6	262200	262205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640351
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6333	NC_019965	CGC	3	9	262386	262394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640351
6334	NC_019965	GCT	2	6	262451	262456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640351
6335	NC_019965	CAT	2	6	262472	262477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640351
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6338	NC_019965	TGG	3	9	262600	262608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640351
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6343	NC_019965	GGT	2	6	262790	262795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640352
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6346	NC_019965	CGC	2	6	262955	262960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433640352
6347	NC_019965	CGA	2	6	262982	262987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640352
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6355	NC_019965	ATCG	2	8	263249	263256	25 %	25 %	25 %	25 %	433640352
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6358	NC_019965	CGGC	2	8	263386	263393	0 %	0 %	50 %	50 %	433640352
6359	NC_019965	GTCG	2	8	263471	263478	0 %	25 %	50 %	25 %	433640352
6360	NC_019965	GGT	2	6	263483	263488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640352
6361	NC_019965	GGA	2	6	263513	263518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433640352
6362	NC_019965	TCG	2	6	263545	263550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640352
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6364	NC_019965	TAC	2	6	263960	263965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433640353
6365	NC_019965	TGCACA	2	12	263987	263998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433640353
6366	NC_019965	GACA	2	8	264031	264038	50 %	0 %	25 %	25 %	433640353
6367	NC_019965	GC	3	6	264201	264206	0 %	0 %	50 %	50 %	433640353
6368	NC_019965	G	6	6	264210	264215	0 %	0 %	100 %	0 %	433640353
6369	NC_019965	CGA	2	6	264228	264233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640353
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6372	NC_019965	GGT	2	6	264327	264332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433640353
6373	NC_019965	GCTG	2	8	264351	264358	0 %	25 %	50 %	25 %	433640353
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6380	NC_019965	CTGC	2	8	264865	264872	0 %	25 %	25 %	50 %	433640353
6381	NC_019965	CGA	2	6	264879	264884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640353
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6386	NC_019965	G	6	6	265101	265106	0 %	0 %	100 %	0 %	433640353
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6394	NC_019965	GTC	3	9	265621	265629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640354
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6401	NC_019965	CG	3	6	265891	265896	0 %	0 %	50 %	50 %	433640354
6402	NC_019965	TGC	2	6	265947	265952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640354
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6476	NC_019965	CG	3	6	268532	268537	0 %	0 %	50 %	50 %	433640356
6477	NC_019965	TCTGC	2	10	268596	268605	0 %	40 %	20 %	40 %	433640357
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6480	NC_019965	CGCT	2	8	268727	268734	0 %	25 %	25 %	50 %	433640357
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6484	NC_019965	CGG	2	6	268932	268937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433640357
6485	NC_019965	CTGGTA	2	12	268941	268952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433640357
6486	NC_019965	GAT	2	6	268991	268996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433640357
6487	NC_019965	TCGGC	2	10	269000	269009	0 %	20 %	40 %	40 %	433640357
6488	NC_019965	GTCGA	2	10	269016	269025	20 %	20 %	40 %	20 %	433640357
6489	NC_019965	TGT	2	6	269026	269031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433640357
6490	NC_019965	AGCG	2	8	269112	269119	25 %	0 %	50 %	25 %	433640357
6491	NC_019965	CGA	2	6	269144	269149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433640357
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6497	NC_019965	TGC	2	6	269407	269412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433640357
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